151 research outputs found

    Diversidad morfológica y molecular de los Unionidae (Mollusca, Bivalvia) de Portugal

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    Freshwater mussels from the family Unionidae are known to exhibit a high level of ecological phenotypic plasticity that is reflected in their shell shape. This variation has caused uncertainty on systematics and taxonomy of the group. Several naiad populations from nine river basins from Portugal were analyzed genetically, using two mitochondrial gene fragments (16SrRNA and Cytochrome Oxidase I) and morphologically, using ANOVA analyses of shell dimmensions. Molecular phylogenetic analyses were used to revise the systematics and to infer an evolutionary hypothesis for the family at the western-most Atlantic Iberian Peninsula. Genetic and morphological data were in agreement and supported the occurrence of 5 species in the region: Anodonta anatina, Anodonta cygnea, Potomida littoralis, Unio tumidiformis and Unio delphinus. The differentiation of all these species, except A. cygnea, is thought to have taken place during the isolation of the Iberian Peninsula and formation of the current river basins in the Tertiary. The possibility of A. cygnea being a relatively recent introduction is discussed. Basic morphometric measures of the shell proved to be useful to separate Unio species, but also seem to be strongly affected by environmental conditions. The high intra-specific morphologic variation was partially related to the species’ high level of phenotypic plasticity, but seems to have an important role in evolutionary processes.Las náyades de la familia Unionidae tienen gran plasticidad fenotípica, lo que se refleja en la forma de su concha. Esta variabilidad morfológica ha sido causa de gran confusión en la taxonomía y sistemática del grupo. Se han estudiado, genética y morfológicamente, numerosas poblaciones de náyades provenientes de nueve cuencas hidrográficas portuguesas. Para ello se han analizando dos fragmentos de genes mitocondriales (ARNr 16S y Citocromo Oxidasa I) así como diferentes variables morfológicas de la concha. Se han realizado además análisis filogenéticos para conocer la sistemática de la familia e inferir una hipótesis evolutiva de su distribución en el oeste de la península Ibérica. Los datos genéticos y morfológicos sugieren la existencia de cinco especies: Anodonta anatina, Anodonta cygnea, Potomida littoralis, Unio tumidiformis y Unio delphinus. La diferenciación de estas especies, con la excepción de A. cygnea, ha ocurrido durante el aislamiento de la península Ibérica y posterior formación de las actuales cuencas hidrográficas en el Terciario. Se discute la posibilidad de que la presencia de A. cygnea se deba a una introducción reciente. Los datos morfométricos analizados pueden ser útiles para separar las especies del género Unio, pero son también dependientes de las condiciones ambientales. La elevada variabilidad morfológica dentro de cada especie está relacionada con su plasticidad fenotípica, pero tiene a su vez un importante papel en el proceso evolutivo

    Preliminary results from characterization of the Iberian Peninsula sturgeon based on analysis of the mtDNA cytochrome b

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    Historically, the Atlantic sturgeon Acipenser sturio L., 1758 was considered the only sturgeon species that inhabited rivers of the Iberian Peninsula. Nevertheless, in a recent paper, Garrido- Ramos et al. (1997) identified specimen EBD 8174 (museum collection of the Doñana Biological Station, Spain), from the Guadalquivir River, as the Adriatic sturgeon Acipenser naccarii Bonaparte, 1836, suggesting that both A. sturio and A. naccarii could be native to Spain. To test this theory, we compared partial mitochondrial cytochrome b (cyt b) gene sequences obtained from museum specimens of A. sturio that originated from the Iberian Peninsula, the Adriatic and the North Sea, as well as from live individuals of the Gironde River population in France. Specimens of A. naccarii and of the Siberian sturgeon Acipenser baerii Brandt, 1869 from fish farms were also included in the study. DNA from museum specimens was successfully amplified using the protocol of France and Kocher (1996) for DNA extraction from formalin-fixed and ethanol-preserved samples. Phylogenetic analysis was performed on partial cyt b gene sequences (over 402-bp and 245-bp). We identified specimen EBD 8174 as A. sturio, confirming the opinion that A. sturio is the only sturgeon species of the Iberian Peninsula. Further molecular analyses of museum specimens are needed for a description of the historical intraspecies genetic variation within A. sturio. This information is crucial for any future recovery plan for this species. Our comparison also showed interspecies sequence divergence ranging from 6.91% (A. sturio/A. naccarii) to 7.43% (A. sturio/A. baerii).Históricamente, el esturión atlántico Acipenser sturio L., 1758 ha sido considerado la única especie de esturión que vive en los ríos de la península Ibérica, siendo así demostrado por múltiples estudios morfológicos recientes. Sin embargo, un trabajo reciente identificó el ejemplar del río Guadalquivir EBD 8174 como Acipenser naccarii Bonaparte, 1836, sugiriendo que ambas especies de esturión podrían ser nativas de España. Para comprobar esta nueva teoría, se han analizado las secuencias del gen citocromo b mitocondrial en muestras de esturión atlántico preservadas en varios museos procedentes de la península Ibérica, el mar Adriático y el mar del Norte, así como material fresco del río Garona. Además, se han estudiado con fines comparativos varias muestras de A. naccarii y Acipenser baerii Brandt, 1869 procedentes de piscifactorías. Las muestras de museos fueron amplificadas con éxito usando un protocolo específico utilizado para material fijado en formol y preservado en alcohol. La muestra de esturión de España (EBD 8174) fue identificada como A. sturio. Este resulta do confirma que A. sturio es la única especie de esturión en la península Ibérica. De cualquier manera, antes de abordar los planes de recuperación, sería necesario realizar análisis moleculares complementarios para describir las posibles variaciones genéticas existentes entre poblaciones. La comparación de las secuencias de citocromo b de A. sturio con A. naccarii y A. baerii mostró valores de divergencia de 6,91% y 7,43% respectivamente.Instituto Español de Oceanografí

    Polymorphism of mitochondrial genes in populations of Leporinus friderici (Bloch, 1794) : intraspecific structure and zoogeography of the neotropical fish

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    On the basis of faunistic and floristic inventories, various authors have developed the forest refuge theory explain species diversity in humid tropical regions. Renno et al. (1990) used electrophoretic markers to study the genetiic structure of #Leporinus friderici$ and suggested the existence of an aquatic refuge on the Guiana shield. In the present study, mitochondrial markers (RFLP) confirmed and complemented the previous electrophoretic study. Four multimorphs were evidenced, allowing the populations to be separated into sets on either side of the eastern edge of the Guiana refuge, i.e. the Kourou river region in French Guiana. (Résumé d'auteur

    Leve diferenciación genética entre los límites occidental y oriental de distribución de Astroides calycularis (Pallas, 1776) (Anthozoa, Scleractinia, Dendrophylliidae), inferida a partir de secuencias de COI e ITS

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    Understanding population genetic structure and differentiation among populations is useful for the elaboration of management and conservation plans of threatened species. In this study, we use nuclear and mitochondrial markers (internal transcribed spacers -ITS and cytochrome oxidase subunit one -COI) for phylogenetics and nested clade analyses (NCA), thus providing the first assessment of the genetic structure of the threatened Mediterranean coral Astroides calycularis (Pallas, 1766), based on samples from 12 localities along its geographic distribution range. Overall, we found no population differentiation in the westernmost region of the Mediterranean; however, a slight differentiation was observed when comparing this region with the Tyrrhenian and Algerian basins.El estudio de la estructura de las poblaciones y su diferenciación a nivel genético es de gran utilidad para la elaboración de planes de manejo y conservación de especies amenazadas. En este estudio, utilizamos marcadores nucleares y mitocondriales (espaciadores internos de genes ribosomales -ITS y citocromo oxidasa, subunidad I -COI) y métodos de análisis filogenéticos y de clados anidados (NCA), para realizar la primera valoración de la estructura genética del coral naranja Astroides calycularis (Pallas, 1766), una especie amenazada del Mediterráneo, a partir de muestras de 12 localidades a lo largo de su área de distribución. En las localidades situadas en la región más occidental del Mediterráneo se encontró cierta homogeneidad genética, mientras que al comparar estas localidades con las de las cuencas argelina y del mar Tirreno se observó una ligera diferenciación

    Diploid and tetraploid African Barbus (Osteichthyes, Cyprinidae) : on the coding of differential gene expression

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    Trois espèces du groupe des "petits" barbeaux d'Afrique de l'Ouest ont été analysés par électrophorèse des protéines enzymatiques afin d'estimer leur différenciation génétique. La comparaison avec une espèce de "grand" barbeau de la même région a montré que les "petits" barbeaux seraient diploïdes et les "grands" tétraploïdes. Ils constituent certainement deux lignées distinctes. Des arbres phénétiques (distances de Nei) et cladistiques (réseaux de compatibilité) du genre #Barbus$ sont proposés comprenant les trois espèces diploïdes africaines, deux espèces diploïdes d'Arabie et d'Asie du sud-est, une espèce tétraploïdes de France. Ces arbres présentent deux ensembles : les diploïdes d'un côté et les tétraploïdes de l'autre. Plusieurs méthodes de traitement des données sont proposées pour résoudre les difficultés dues au traitement simultané d'espèces à niveau de ploïdie différent. (Résumé d'auteur

    Phylogeographic patterns of Capreolus capreolus in the centre of the Iberian peninsula

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    One hundred and one samples of muscle tissue were obtained from roe deer in the centre of the Iberian peninsula. We compared the sequences of the control region (D–loop) of the mitochondrial DNA of these samples with those obtained in previous studies. Adding the information from microsatellite markers and derived genetic parameters to study the population structure, we found a philopatric structure, with females maintaining mitochondrial haplotype diversity, while males showed a pattern of genome homogenization. The population can thus be considered panmictic. Different times of palaeohistory of the species may explain these results: glacial–interglacial stages of the Pleistocene and the reduction and recovery of populations throughout the 20th century
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